Avis des lecteurs
Résumé:Le livre sur la bio-informatique avec Python est loué pour sa couverture complète et ses conseils pratiques, tant pour les débutants que pour les utilisateurs expérimentés. Cependant, il présente des lacunes importantes, notamment des exemples de code problématiques et une qualité d'impression médiocre, qui nuisent à sa valeur en tant que référence.
Avantages:⬤ Une couverture complète des sujets liés à la bio-informatique et des considérations relatives à la gestion de projet.
⬤ Excellents exercices pratiques pour des tâches bioinformatiques réelles.
⬤ Convient aussi bien aux débutants qu'aux utilisateurs expérimentés, avec des outils et des sujets actualisés.
⬤ Fournit des ressources et des conseils utiles pour développer des compétences Python en bioinformatique.
⬤ De nombreux exemples de code ne fonctionnent pas ou sont obsolètes, ce qui entraîne une certaine frustration.
⬤ Qualité d'impression médiocre avec des pages mal imprimées et des illustrations en noir et blanc.
⬤ Certains utilisateurs ont trouvé que les explications manquaient de clarté et n'étaient pas utiles par rapport à d'autres ressources.
(basé sur 10 avis de lecteurs)
Titre original :
Bioinformatics with Python Cookbook - Third Edition: Use modern Python libraries and applications to solve real-world computational biology problems
Contenu du livre :
Découvrez les bibliothèques de séquençage modernes de nouvelle génération du puissant écosystème Python pour effectuer des recherches de pointe et analyser de grandes quantités de données biologiques.
Caractéristiques principales :
⬤ Réalisez des analyses bioinformatiques complexes à l'aide des bibliothèques et applications Python les plus essentielles.
⬤ Les applications de séquençage de nouvelle génération, de métagénomique, d'automatisation des analyses, de génétique des populations, et bien plus encore.
⬤ Les techniques statistiques et d'apprentissage automatique pour l'analyse des données bioinformatiques.
Description du livre :
La bioinformatique est un domaine de recherche actif qui utilise une gamme de calculs simples à avancés pour extraire des informations précieuses des données biologiques, et ce livre vous montrera comment gérer ces tâches à l'aide de Python.
Cette troisième édition mise à jour du livre de cuisine Bioinformatics with Python commence par une présentation rapide des différents outils et bibliothèques de l'écosystème Python qui vous aideront à convertir, analyser et visualiser des ensembles de données biologiques. Ensuite, vous couvrirez les techniques clés du séquençage de nouvelle génération, de l'analyse unicellulaire, de la génomique, de la métagénomique, de la génétique des populations, de la phylogénétique et de la protéomique à l'aide d'exemples du monde réel. Vous apprendrez à travailler avec d'importants systèmes de pipeline, tels que les serveurs Galaxy et Snakemake, et comprendrez les différents modules de Python pour la programmation fonctionnelle et asynchrone. Ce livre vous aidera également à explorer des sujets tels que la découverte de SNP à l'aide d'approches statistiques dans des cadres de calcul à haute performance, notamment Dask et Spark. En outre, vous explorerez l'application des algorithmes d'apprentissage automatique en bio-informatique.
À la fin de ce livre Python sur la bio-informatique, vous serez équipé des connaissances dont vous avez besoin pour mettre en œuvre les dernières techniques et cadres de programmation, vous permettant de traiter les données bio-informatiques à toutes les échelles.
Ce que vous apprendrez :
⬤ Maîtriser les bibliothèques de traitement de données telles que NumPy, pandas, arrow et zarr dans le contexte de l'analyse bioinformatique.
⬤ Interagir avec les bases de données génomiques.
⬤ Résoudre des problèmes concrets dans les domaines de la génétique des populations, de la phylogénétique et de la protéomique.
⬤ Construire des pipelines bioinformatiques en utilisant un serveur Galaxy et Snakemake.
⬤ Travailler avec functools et itertools pour la programmation fonctionnelle.
⬤ Effectuer des traitements parallèles avec Dask sur des données biologiques.
⬤ Explorer les techniques d'analyse en composantes principales (ACP) avec scikit-learn.
A qui s'adresse ce livre :
Ce livre s'adresse aux analystes en bio-informatique, aux data scientists, aux biologistes computationnels, aux chercheurs et aux développeurs Python qui souhaitent s'attaquer à des problèmes biologiques et bio-informatiques de niveau intermédiaire à avancé. Une connaissance pratique du langage de programmation Python est attendue. Des connaissances de base en biologie seront également utiles.
Autres informations sur le livre :
| ISBN : | 9781803236421 |
| Auteur : | |
| Éditeur : | |
| Langue : | anglais |
| Reliure : | Broché |
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