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Using R for Modelling and Quantitative Methods in Fisheries
Using R for Modelling and Quantitative Methods in Fisheries a évolué et a été adapté à partir d'un livre précédent du même auteur et fournit une introduction détaillée aux méthodes analytiques couramment utilisées par les scientifiques de la pêche, les écologistes et les étudiants avancés en utilisant le logiciel libre R comme outil de programmation. Une certaine connaissance de R est supposée, puisqu'il s'agit d'un livre sur l'utilisation de R, mais une introduction au développement et au fonctionnement des fonctions, et à la façon dont on peut explorer le contenu des fonctions et des paquets R, est fournie.
Les analyses d'exemples se déroulent étape par étape en utilisant le code listé dans le livre et dans le package R qui l'accompagne, MQMF, disponible sur GitHub et dans l'archive standard, CRAN. Les exemples sont conçus pour être simples à modifier afin que le lecteur puisse rapidement adapter les méthodes décrites pour les utiliser avec ses propres données. L'un des principaux objectifs de ce livre est d'être une ressource utile pour les praticiens et les étudiants en ressources naturelles.
Chapitres présentés :
⬤ Model Parameter Estimation fournit une explication détaillée des exigences et des étapes impliquées dans l'ajustement des modèles aux données, en utilisant R et, principalement, les méthodes du maximum de vraisemblance.
⬤ On Uncertainty utilise R pour mettre en œuvre le bootstrapping, les profils de vraisemblance, les erreurs asymptotiques et les postérités bayésiennes afin de caractériser toute incertitude dans une analyse. L'utilisation de la méthodologie de la chaîne de Markov de Monte Carlo est examinée en détail.
⬤ Les modèles de production excédentaire appliquent toutes les méthodes examinées dans les parties précédentes du livre à la réalisation d'une évaluation des stocks. Il s'agit notamment d'adapter des modèles alternatifs aux données disponibles, de caractériser l'incertitude de différentes manières et de projeter les modèles optimaux dans le temps afin de fournir des conseils de gestion utiles.
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Dernière modification: 2024.11.14 07:32 (GMT)