Protein-Protein Interaction Networks: Methods and Protocols
Ce volume explore les techniques qui étudient les interactions entre les protéines de différentes espèces, et les combine avec des données spécifiques au contexte, l'analyse d'ensembles de données omiques, et assemble les interactions individuelles en unités sémantiques d'ordre supérieur, c'est-à-dire des complexes protéiques et des modules fonctionnels. Les chapitres de ce livre couvrent des méthodes informatiques qui permettent de résoudre diverses tâches telles que la prédiction des interactions fonctionnelles protéine-protéine.
La comparaison des réseaux d'interaction basée sur l'alignement par SANA.
L'utilisation du serveur web RaptorX-ComplexContact pour prédire les contacts résidu-résidu inter-protéines.
L'amarrage de confirmations alternatives de protéines participant à des interactions binaires et la sélection guidée visuellement d'un modèle d'amarrage à l'aide de COZOID.
La détection de nouvelles unités fonctionnelles par KeyPathwayMiner et la façon dont PathClass peut utiliser ces voies de novo pour classer les sous-types de cancer du sein. Rédigés selon le format très apprécié de la série Methods in Molecular Biology, les chapitres comprennent des introductions à leurs sujets respectifs, des listes du matériel et des logiciels nécessaires, des protocoles de calcul étape par étape et facilement reproductibles, ainsi que des conseils pour résoudre les problèmes et éviter les pièges connus.
A la pointe du progrès et complet, Protein-Protein Interaction Networks : Methods and Protocols est une ressource précieuse pour les chercheurs novices et experts qui souhaitent en savoir plus sur ce domaine en pleine évolution.
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Dernière modification: 2024.11.14 07:32 (GMT)