Perl pour la bioinformatique

Note :   (4,4 sur 5)

Perl pour la bioinformatique (James Tisdall)

Avis des lecteurs

Résumé:

Le livre « Beginning Perl for Bioinformatics » est une ressource visant à enseigner la programmation Perl spécifiquement pour les personnes travaillant dans les sciences biologiques, en particulier la bio-informatique. Il est conçu pour les débutants sans expérience préalable de la programmation et a reçu des commentaires positifs pour ses explications claires, ses exemples pratiques et sa capacité à démystifier les concepts de programmation. Cependant, plusieurs critiques mentionnent que le livre n'est peut-être pas assez complet et qu'il pourrait être dépassé, ce qui pourrait entraîner des problèmes de débogage des scripts.

Avantages:

Bien organisé et facile à comprendre pour les débutants.
Fournit une introduction douce à Perl avec des applications pratiques en bio-informatique.
Inclut des exemples clairs et des exercices pertinents pour les problèmes biologiques.
Enseigne efficacement les concepts de base de la programmation et les expressions régulières.
Hautement recommandé comme point de départ pour les biologistes désireux d'apprendre la programmation.

Inconvénients:

Certains utilisateurs ont trouvé le livre trop basique et pas assez approfondi pour les apprenants plus avancés.
De nombreux évaluateurs ont noté qu'il était obsolète, ce qui peut entraîner des problèmes de débogage des scripts.
Certains exemples et explications pourraient être améliorés, en particulier pour les sujets complexes.
Ne convient pas à ceux qui ont déjà des connaissances en Perl.

(basé sur 47 avis de lecteurs)

Titre original :

Beginning Perl for Bioinformatics

Contenu du livre :

Grâce à sa capacité hautement développée à détecter des modèles dans les données, Perl est devenu l'un des langages les plus populaires pour l'analyse des données biologiques. Mais si vous êtes un biologiste avec peu ou pas d'expérience en programmation, commencer à utiliser Perl peut être un défi. De nombreux biologistes ont du mal à apprendre comment appliquer le langage à la bioinformatique. Les livres de programmation Perl les plus populaires sont souvent trop théoriques et trop axés sur l'informatique pour un biologiste non programmeur qui a besoin de résoudre des problèmes très spécifiques. Beginning Perl for Bioinformatics est conçu pour vous permettre de franchir rapidement la barrière du langage Perl en abordant la programmation comme une nouvelle compétence de laboratoire importante, révélant des programmes et des techniques Perl immédiatement utiles en laboratoire. Chaque chapitre se concentre sur la résolution d'un problème bioinformatique particulier ou d'une classe de problèmes, en commençant par le plus simple et en augmentant la complexité au fur et à mesure que le livre progresse. Chaque chapitre comprend des exercices de programmation et enseigne la bio-informatique en montrant et en modifiant des programmes qui traitent de divers types de problèmes biologiques pratiques. À la fin du livre, vous aurez une solide compréhension des bases de Perl, une collection de programmes pour des tâches telles que l'analyse de BLAST et de GenBank, et les compétences nécessaires pour entreprendre une programmation bioinformatique plus avancée. Certains des derniers chapitres se concentrent plus en détail sur des sujets bioinformatiques spécifiques.

Ce livre peut être utilisé comme manuel scolaire, pour l'auto-apprentissage et comme référence. Il couvre les points suivants Les bases de la programmation et le travail avec les séquences et les chaînes d'ADN.

Débogage du code.

Simulation de mutations génétiques à l'aide de générateurs de nombres aléatoires.

Expressions régulières et recherche de motifs dans les données.

Tableaux, hachages et bases de données relationnelles.

Expressions régulières et cartes de restriction.

Utilisation de Perl pour analyser les enregistrements PDB, les annotations dans GenBank et les résultats de BLAST.

Autres informations sur le livre :

ISBN :9780596000806
Auteur :
Éditeur :
Reliure :Broché
Année de publication :2001
Nombre de pages :370

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Dernière modification: 2024.11.14 07:32 (GMT)