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Next-Generation DNA Sequencing Informatics, Second Edition
La technologie de séquençage de l'ADN de nouvelle génération (NGS) a révolutionné la recherche biomédicale, faisant du séquençage du génome et de l'ARN un outil abordable et fréquemment utilisé pour une grande variété d'applications de recherche, notamment la découverte de variantes (mutations), l'expression génétique, l'analyse des facteurs de transcription, la métagénomique et l'épigénétique. Les méthodes bioinformatiques destinées à soutenir le séquençage de l'ADN sont devenues et restent un goulot d'étranglement critique pour de nombreux chercheurs et organisations souhaitant utiliser la technologie NGS. Cette nouvelle édition propose une introduction complète, en langage clair, aux méthodes et outils informatiques nécessaires à l'analyse des données NGS et fournit des descriptions détaillées des algorithmes, des forces et faiblesses d'outils spécifiques, des pièges et des méthodes alternatives. Quatre nouveaux chapitres couvrent la conception expérimentale, la préparation des échantillons et l'évaluation de la qualité des données NGS.
Bases de données publiques pour les données de séquençage de l'ADN.
l'assemblage de novo des transcriptions
la protéogénomique.
et les technologies de séquençage émergentes. Les chapitres restants de la première édition ont été mis à jour avec les informations les plus récentes. Ce livre fournit également des références étendues aux méthodes bioinformatiques les plus performantes pour les applications NGS et des tutoriels pour les flux de travail courants. Cette édition répond aux besoins informatiques des étudiants, des scientifiques de laboratoire et des informaticiens qui souhaitent profiter de l'explosion des possibilités de recherche offertes par les nouvelles technologies de séquençage de l'ADN.
Auteurs
Alexander Alekseyenko.
Silvia Argim3n.
Brian D. Athey.
Miroslav Blumenberg.
Stuart M. Brown.
Lisa Cohen.
Efstratios Efstathiadis.
David Feny.
Jeremy Goecks.
Gerald A. Higgins.
D. Frank Hsu.
Kranti Konganti.
Konstantinos Krampis.
Guillermo I. Perez-Perez.
Kelly V. Ruggles.
Christina Schweikert.
Steven Shen.
Phillip Ross Smith.
Zuojian Tang.
Jinhua Wang.
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Dernière modification: 2024.11.14 07:32 (GMT)