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Titre original :
Bioinformatics study of elements potentially involved in response to light in Metarhizium
Contenu du livre :
La lumière est l'un des facteurs abiotiques constants sur la planète et pratiquement tous les organismes vivants présentent un certain type de réponse au stimulus lumineux. Un aspect important de la réception de la lumière est la modulation des gènes ; ce mécanisme implique la stimulation ou l'inhibition de l'expression de certains gènes qui, éventuellement, ont pour but de s'adapter à différentes conditions environnementales. Chez les champignons, la réponse à la lumière a un effet très important sur les gènes impliqués dans la régulation circadienne ; dans ce processus, les produits des gènes frq et frh régulent l'activité du complexe du col blanc (WCC) en fonction du temps.
Ce phénomène est largement étudié chez les organismes saprophytes, mais l'étude des composants moléculaires et des mécanismes impliqués dans la chronobiologie et la photobiologie chez les champignons entomopathogènes est relativement récente. Chez Metarhizium, il existe des rapports sur les effets phénotypiques causés par le stimulus lumineux, y compris la croissance en lumière constante ou en photopériode, mais il n'y a pas de description complète du mécanisme qui conduit à ces caractéristiques phénotypiques photodépendantes.
En se basant sur la large distribution des gènes de réponse à la lumière chez les champignons filamenteux, nous avons effectué une analyse bioinformatique sur le contexte subgénomique de ces gènes en utilisant les logiciels Mauve et RStudio. Nous avons trouvé que les gènes de réponse à la lumière semblent être constants dans les génomes analysés démontrant une conservation micro-synténique parmi le genre Metarhizium, à l'exception du gène wc2. Pour mieux comprendre la régulation transcriptionnelle possible, nous avons analysé les promoteurs des gènes de réponse à la lumière à la recherche d'éléments cis-régulateurs putatifs, trouvant des motifs conservés dans toutes les espèces de Metarhizium analysées ; cette approche nous a permis d'identifier d'autres gènes possibles de réponse à la lumière et de contrôle circadien dans le génome de ce genre.
Enfin, nous proposons différents mécanismes dépendant de la lumière, ainsi que leurs composants moléculaires putatifs et les gènes impliqués dans ces phénotypes caractéristiques.
Autres informations sur le livre :
| ISBN : | 9789994987252 |
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| Langue : | anglais |
| Reliure : | Broché |
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