Biologie quantitative : Théorie, méthodes de calcul et modèles

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Biologie quantitative : Théorie, méthodes de calcul et modèles (Brian Munsky)

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Titre original :

Quantitative Biology: Theory, Computational Methods, and Models

Contenu du livre :

Une introduction à la modélisation quantitative des processus biologiques, présentant les approches de modélisation, la méthodologie, les algorithmes pratiques, les outils logiciels et des exemples de la recherche actuelle.

La modélisation quantitative des processus biologiques promet d'étendre la recherche biologique d'une science d'observation et de découverte à une science de prédiction rigoureuse et d'analyse quantitative. Le domaine en plein essor de la biologie quantitative cherche à utiliser les capacités technologiques et informatiques émergentes de la biologie pour modéliser les processus biologiques. Ce manuel propose une introduction à la théorie, aux méthodes et aux outils de la biologie quantitative.

Le livre présente d'abord les fondements de la modélisation biologique, en se concentrant sur certains des formalismes les plus largement utilisés. Il présente ensuite une méthodologie essentielle pour les analyses de données biologiques guidées par des modèles, couvrant des méthodes telles que la reconstruction de réseaux, la quantification de l'incertitude et la conception expérimentale, des algorithmes pratiques et des progiciels pour la modélisation des systèmes biologiques, ainsi que des exemples spécifiques de la recherche actuelle en biologie quantitative et des méthodes spécialisées qui s'y rapportent. La plupart des chapitres proposent des problèmes, allant du plus simple au plus complexe, qui permettent de tester la maîtrise par le lecteur de techniques clés telles que les simulations déterministes et stochastiques et l'analyse de données. De nombreux chapitres comprennent des extraits de code qui peuvent être utilisés pour recréer des analyses et générer des figures en rapport avec le texte. Les exemples sont présentés dans les trois langages informatiques les plus courants : Matlab, R et Python. De nombreuses ressources en ligne complètent le texte.

Les rédacteurs sont des organisateurs de longue date de l'école d'été annuelle de q-bio, qui a été fondée en 2007. Grâce à cette école, les éditeurs ont contribué à former plus de 400 étudiants invités à Los Alamos, NM, Santa Fe, NM, San Diego, CA, Albuquerque, NM, et Fort Collins, CO. Ce livre s'inspire des programmes de l'école, et la plupart des auteurs ont participé à l'école en tant qu'étudiants, conférenciers ou les deux.

Contributeurs.

John H. Abel, Roberto Bertolusso, Daniela Besozzi, Michael L. Blinov, Clive G. Bowsher, Fiona A. Chandra, Paolo Cazzaniga, Bryan C. Daniels, Bernie J. Daigle, Jr, Maciej Dobrzynski, Jonathan P. Doye, Brian Drawert, Sean Fancer, Gareth W. Fearnley, Dirk Fey, Zachary Fox, Ramón Grima, Andreas Hellander, Stefan Hellander, David Hofmann, Damian Hernandez, William S. Hlavacek, Jianjun Huang, Tomasz Jetka, Dongya Jia, Mohit Kumar Jolly, Boris N. Kholodenko, Markek Kimmel, Michal Komorowski, Ganhui Lan, Heeseob Lee, Herbert Levine, Leslie M Loew, Jason G. Lomnitz, Ard A. Louis, Grant Lythe, Carmen Molina-Par s, Ion I. Moraru, Andrew Mugler, Brian Munsky, Joe Natale, Ilya Nemenman, Karol Nienaltowski, Marco S. Nobile, Maria Nowicka, Sarah Olson, Alan S. Perelson, Linda R. Petzold, Sreenivasan Ponnambalam, Arya Pourzanjani, Ruy M. Ribeiro, William Raymond, Herbert M. Sauro, Michael A. Savageau, Abhyudai Singh, James C. Savageau, Abhyudai Singh. Schaff, Boris M. Slepchenko, Thomas R. Sokolowski, Petr Sulc, Andrea Tangherloni, Pieter Rein ten Wolde, Philipp Thomas, Karen Tkach Tuzman, Lev S. Tsimring, Dan Vasilescu, Margaritis Voliotis, Lisa Weber.

Autres informations sur le livre :

ISBN :9780262038089
Auteur :
Éditeur :
Reliure :Relié
Année de publication :2018
Nombre de pages :728

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Dernière modification: 2024.11.14 07:32 (GMT)