Analyse des données Rna-Seq : Une approche pratique

Note :   (4,3 sur 5)

Analyse des données Rna-Seq : Une approche pratique (Eija Korpelainen)

Avis des lecteurs

Résumé:

Ce livre est très apprécié pour son introduction détaillée à la technologie RNAseq, ce qui le rend idéal pour les débutants et les enseignants en bioinformatique. Il couvre les applications pratiques de manière exhaustive, inclut des instructions en ligne de commande et fournit des exemples de la vie réelle pour faciliter l'apprentissage. Toutefois, certains utilisateurs ont relevé des problèmes de disponibilité des données sur les sites web recommandés et ont estimé que certains aspects techniques, en particulier ceux liés à R, étaient sous-représentés.

Avantages:

Très pratique et complet
excellent pour les débutants
comprend des instructions étape par étape et des exemples réels
bon pour l'enseignement
autonome et couvre divers outils et méthodes RNAseq.

Inconvénients:

Certains ensembles de données n'étaient pas accessibles
ne couvre peut-être pas tous les outils pertinents
section sur R sous-représentée
plus orienté vers les bioinformaticiens que vers les scientifiques de laboratoire.

(basé sur 15 avis de lecteurs)

Titre original :

Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach

Contenu du livre :

Les données de séquençage de l'ARN (ARN-seq) offrent des informations sans précédent sur le transcriptome, mais l'exploitation de ces informations à l'aide d'outils bioinformatiques constitue généralement un goulot d'étranglement. L'analyse des données RNA-seq RNA-seq Data Analysis : A Practical Approach permet aux chercheurs d'examiner l'expression différentielle au niveau des gènes, des exons et des transcrits et de découvrir de nouveaux gènes, transcrits et transcriptomes entiers.

Chaque chapitre commence par un contexte théorique, suivi de descriptions d'outils d'analyse pertinents et d'exemples pratiques. Accessibles à la fois aux bioinformaticiens et aux scientifiques non programmateurs des laboratoires humides, les exemples illustrent l'utilisation d'outils en ligne de commande, de R et d'autres outils open source, tels que le logiciel graphique Chipster.

Les outils et les méthodes pour démarrer dans votre laboratoireEn accompagnant les lecteurs tout au long du processus d'analyse des données, ce guide autonome fournit une vue d'ensemble détaillée des principales méthodes d'analyse des données RNA-seq et explique comment les utiliser en pratique. Il s'adresse à des chercheurs de tous horizons, notamment en biologie, en médecine, en génétique et en informatique. Il peut également être utilisé dans le cadre d'un cours de troisième cycle ou d'un cours avancé de premier cycle.

Autres informations sur le livre :

ISBN :9781466595002
Auteur :
Éditeur :
Reliure :Relié
Année de publication :2014
Nombre de pages :322

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Dernière modification: 2024.11.14 07:32 (GMT)